Klasyczny podpis kwalifikowany jest tylko narzędziem do wstawiania podpisu do dokumentu. W jaki sposób możesz złożyć podpis kwalifikowany? Cały proces składania podpisu musi być koordynowany ręcznie, co bywa uciążliwe szczególnie wtedy, gdy na dokumencie w różnych miejscach ma złożyć swój podpis kilka osób.
Każdorazowe złożenie podpisu trzeba potwierdzić np. przy pomocy specjalnej karty, sticka z certyfikatem lub certyfikatu w chmurze. Sam certyfikat kwalifikowany nie daje również możliwości wskazania w dokumencie miejsc, w których mają być złożone podpisy – wszystkie instrukcje muszą być przekazane ustnie lub pisemnie, np. w treści wiadomości mailowej.
Dokument podpisany przez jedną osobę musi być przesłany do kolejnych drogą mailową. Każda z osób uprawnionych do podpisu musi pobrać plik na swój dysk, użyć swojego certyfikatu, zapisać plik, załączyć go do wiadomości mailowej i wysłać dalej. Taki proces jest bardzo czasochłonny i narażony na opóźnienia – istnieje ryzyko, że plik utknie u kogoś, kto w danym momencie ma dużo pracy, a mail z dokumentem utonie w morzu innych wiadomości.